2015年9月30日にEl Capitanがリリースされたそうなので、1年くらい経ってしまったが、ようやくMac bookをEl Capitanにアップグレードしました。
もうすでに、新OS Sierraの噂が飛び交っている中でのアップグレードです。。。
アップグレードはApp Storeから行うだけ。
App Storeのアイコンをクリック

アップデートタブをクリックすると「OSX El Capitan」のアップグレードが表示されているので、「無料アップグレード」をクリック。

OSのダウンロードが開始されます。

ダウンロードが終わるとインストーラが起動するので「続ける」を押下。

使用許諾契約に同意します。

確認のポップアップが表示されるので、同意するをクリック。

インストールの確認があるので、「インストール」をクリック。

電源ケーブルを指していない場合は、電源の確認のポップアップが上がってきます。電源を指していない状態では、インストール完了までに20%くらいバッテリーが減りました。

インストールが開始されます。

再起動の確認が出てきます。問題なければ再起動します。

基本的には以上で完了です。
再起動後、パスワードの入力など行う必要があります。